Богородице-Алексеевский монастырь - православный мужской монастырь в Томске, находится в юрисдикции Томской епархии Русской православной церкви.
Монастырь был основан в 1605 году при устье реки Киргизки на Юртачной горе. Страдал от набегов сибирских народов (калмыков, телеутов, киргизов). В 1656 году была сожжена единственная монастырская церковь Казанской иконы Богородицы. После этого было принято решение перенести монастырь в более безопасное место на берег речки Ушайки. Строительство нового монастыря было завершено в 1663 году.
Из Богородице-Алексеевского монастыря осуществлялось руководство прочими восемью сибирскими монастырями, входившими в Томский разряд. Монастырь до 1764 года был единственным в Томской губернии владельцем 400 крепостных крестьян, а также обладал земельными угодьями на реках Томи и Оби. В XVII веке при монастыре была открыта больница, а в 1746 году первая томская школа - Томское русское духовное училище (в 1762 году преобразовано в русско-латинское). Также при монастыре с 1858 года действовала духовная семинария с обширной библиотекой.
Монастырь, как и другие сибирские обители, был местом ссылки нарушителей монастырских уставов. Также в нем содержались и светские лица. Так, в конце 1720-х годах в монастыре под арестом находился Абрам Ганнибал (прадед Александра Пушкина), сосланный в Сибирь по указания князя Меншикова.
Главным монастырским храмом является Казанская церковь, имеющая также приделы в честь Алексия, человека Божьего и святых Флора и Лавра. Изначально постройка была деревянная, неоднократно сгорала. В 1789 году было построено современное каменное церковное здание в стиле сибирского барокко. В 1830-е годы монастырь окружили каменными стенами и башнями-часовнями (проект томского архитектора К. Турского). На территории находились сад, озеро, летние кельи и кладбище.
В 1864 году на монастырском кладбище был похоронен старец Фёдор Кузьмич, отождествляемый в легендах с императором Александром I. В 1904 году над его могилой по проекту архитектора Викентия Оржешко была построена часовня.
В 1922 году сам монастырь был закрыт, но община верущих при Казанском храме существовала до 1929 года. Монахи в этот период проживали под арестом в братском корпусе, а после закрытия храма вместе с архимандритом были казнены на горе Каштак.
В 1992 году Казанская церковь и келейный корпус монастыря были возвращены верующим. Началось регулярное богослужение. 5 июля 1995 года в выгребной яме на месте разрушенной часовни Федора Кузьмича были обретены его мощи, ставшие главной монастырской реликвией. В 1997 году была восстановлена часовня святого.
Паломнические поездки к Богородице-Алексеевскому монастырю в г. Томск
Фото: Богородице-Алексеевский монастырь
Фото и описание
Богородице-Алексеевский монастырь в Томске – это одна из культовых достопримечательностей города. Монастырь был основан в 1605 г. на реке Большая Киргизка, в девяти верстах от города Томска. Тогда он носил название Усть-Киргизский. Несмотря на то, что обитель имела очень хорошее укрепление и находилась в окружении оборонительных рвов, она постоянно подвергалась набегам татар и кочевых киргизов.
В 1656 г. в результате пожара полностью сгорел деревянный храм монастыря. В 1657 г. обитель перенесли на новое место - Юрточную гору, Томский острог. В 1662 г. на территории монастыря был построен первый деревянный трехпрестольный храм во имя Казанской иконы Божией Матери, с двумя приделами, посвященными мученикам Флору и Лавру, и преподобному Алексию, человеку Божию.
В 1681 г. монастырь являлся одним из старейших сибирских храмов, поэтому царь Феодор Алексеевич принял его под личное покровительство. В 1698 г. при монастыре открыли первую в Томске школу. С XVII ст. здесь начала действовать первая в городе богадельня и больница. В 1764 г. Богородице-Алексеевский монастырь вошел в число штатных и был причислен к третьему классу.
Первый камень современного храма монастыря заложили в 1776 г. Через три года состоялось освящение боковых приделов, а в 1789 г. - главного придела храма во имя Казанской иконы Божией Матери. Казанский храм был построен в архитектурных традициях школы Сибирского барокко, став первым каменным сооружением города. На территории Богородице-Алексеевского монастыря находится один из древнейших погостов Томска.
В 1830-е гг. вокруг монастыря возвели каменные стены и башни-часовни. Автором данного проекта выступил томский архитектор К. Г. Турский. На территории монастыря находились летние кельи, озеро, сад и кладбище, а южнее - монастырская роща, которая сохранялась до начала XX ст.
В 1922 г. монастырь закрыли. В 1941-1945 гг. его использовали в качестве военного госпиталя. Через некоторое время монастырские здания, в том числе и частично разобранную Казанскую церковь, передали Томскому педагогическому техникуму. В 1992 г. здание Казанской церкви и часть келейного корпуса передали в ведение Томскому благочинию РПЦ. Монастырь восстанавливали практически из руин.
На сегодняшний день Богородице-Алексеевский монастырь - один из самых старых действующих православных монастырей на юге Сибири.
Богородице-Алексиевский монастырь основан в 1605г. (на год позже строительства томского острога). Первоначально церковь и строения монастыря были построены из дерева и находились в 9 верстах от острога в устье реки Большая Киргизка. Он назывался Усть-Киргизским или Богородицким. В первый же год монастырь был разрушен льдами во время весеннего половодья, после чего перенесен на версту выше по течению Большой Киргизки на возвышенное место. Однако и на новом месте спокойной жизни не получилось. Монастырь подвергался регулярным нападениям кочевых киргизов и татар, а в 1656г. в результате пожара погиб храм. После этого было принято решение перенести монастырь под защиту томского острога на Юрточную гору.
Строительство на Юрточной горе было завершено в 1663г. Рядом со стоящей на этом месте более 30 лет церковью Алексея Человека Божия, был возведен храм в честь Казанской иконы Божией Матери. С этого момента он начал называться Богородице-Алексиевским. Новый монастырь представлял собой крепость, которая стала частью оборонительных сооружений Томска. Вместе они пережили не одно нападение кочевников.
В 1776г. был заложен каменный храм в честь Казанской иконы Божией Матери, строительство которого было завершено в 1789г. В 1836-1839 гг. по проекту первого томского епископа Агапита и по проекту томского губернского и епархиального архитектора К.Г. Турского вокруг монастыря была возведена каменная ограда с четырьмя наугольными башнями и тремя святыми воротами. Подлинным украшением монастыря стала колокольня каменного собора, построенная в 1860 году. В 1863 году на нее был поднят «Торжественный» 303-пудовый колокол. В 1904г. на могиле старца Феодора Кузьмича (Феодора Томского), которого связывают с императором Александром I, была построена каменная часовня.
После становления советской власти летом 1923г. монастырь был закрыт. Большая часть монахов была схвачена и расстреляна на горе Каштак. Территория монастыря была передана Педагогическому училищу №2 и частично застроена. Монастырь постепенно разрушался несмотря на то, что в 1923г. был взят на учет музейным отделом Главнауки как памятник старины, имеющий государственное значение. Колокольня главного храма, часовня на могиле старца Феодора, угловые башни и ворота были разобраны на кирпичи.
В 80-х годах XX века была проведена частичная реставрация монастыря. Настоящее возрождение началось в 1991г, когда его территория была передана верующим. В 1995г открыт отреставрированный Казанский собор с вновь отстроенной колокольней. В 1996г. возвращен бывший настоятельский корпус, где теперь размещаются монашеские кельи. В 1998г. заново отстроена часовня св.прав. Феодора Томского.
Фотография начала XX века Казанского собора и внутреннего двора монастыря.
Ниже представлены 2 архивные фотографии монастыря и улицы Монастырской (ныне Крылова). 1-я снята в 1903г., вторая - в период 1900-04гг.
В настоящее время в таком ракурсе можно увидеть только часть забора и угловую башню. Храм закрыт пятиэтажкой.
Заново отстроенная крепостная стена теперь защищает не от нападения врагов, а от мирской суеты. В этом месте постоянно образуется автомобильная пробка.
Церковь Казанской иконы Божией Матери с восстановленной колокольней.
Жилой корпус.
Архивная фотография начала XX века часовни над местом погребения св. Феодора Томского. Возле нее видно монастырское кладбище.
Сейчас кладбища нет, а часовня находится на ремонте.
В завершении поста еще одна архивная фотография 1904г. На ней вид с колокольни Казанского храма в сторону ул.Монастырской (Крылова) и Благовещенской церкви (сейчас на ее месте пл.Батенькова). Фотография ошибочно подписана как ул.Преображенская (ныне Дзержинского).
________________________________________ ____________________________________
Дополнительно:
Старейший в Сибири Богородице-Алексеевский мужской монастырь был основан в 1605 году в устье речки Большая Киргизка. В 1658 году из стратегических соображений монастырь перенесли ближе к городу, на Юрточную гору, где и срубили деревянную церковь во имя Алексия Божьего Человека. В 1754 году церковь сгорела от удара молнии. На ее месте в 1789 году построен каменный храм, освященный во имя Казанской иконы Божьей Матери. С 1746 года при монастыре существовала первая на томской земле школа - Томское русское духовное училище.
В 1923 году территория монастыря целиком была отдана под охрану государства, но тем не менее, в 1928-1930 годах была снесена колокольня, частично разобрана церковь, а территория застроена новыми домами. С 1979 года Казанский собор реставрируется.
Каменный замок монастыря с четырьмя наугольными башнями и тремя святыми воротами был построен в 1836-1839 гг. по проекту первого томского епископа Агапита и по проекту томского губернского и епархиального архитектора К.Г. Турского. Каменный двухэтажный братский корпус с покоями настоятеля построен в 1884 г. по проекту епархиального архитектора В.В. Хабарова. Монастырь был закрыт в 1923 г. В 1979-1995 гг. производились работы по реставрации Казанского храма монастыря в его первоначальном виде. В 1992 г. по благословению патриарха Алексия II состоялось открытие монастыря.
По материалам сайта tomsk.gov.ru
В. Богородице-Алексеевский монастырь, 3 класса, в Томске. Основан не ранее начала XVII века, в 7 верстах от Томска, при устье реки Киргизки, и назывался Усть-Киргизским. По случаю частых набегов кигизов и калмыков перенесен в 1656-1662 годах на настоящее место. В монастыре хранится деревянный крест 1662 года и рукописный синодик. На кладбище в ограде монастыря погребен старец Федор Кузьмич.
Из книги С.В. Булгакова «Русские монастыри в 1913 году»
Один из старейших монастырей в Сибири. Основан в 1605 году при устье реки Киргизки, в 9 верстах от Томского острога, и был назван в народе Усть-Киргизским или Богородицким. В первый же год только что отстроенные монастырские строения и церковь были разрушены льдами во время весеннего ледохода, после чего монастырь был перенесен на версту вверх по Большой Киргизке на возвышенное и защищенное от наводнений место. На удалении от Томской крепости положение монастыря было опасным: несмотря на то, что он был хорошо укреплен и окружен оборонительными рвами и насыпью, он часто страдал от набегов кочевых киргизов и татар. Пожар 1656 года уничтожил новоустроенный храм. Очередное строительство остановилось из-за отсутствия средств.
Старец Ефрем, бывший в то время строителем монастыря, принял решение о перенесении монастыря в город с совета воеводы и граждан Томска "...по их согласному выбору места". И поставили монастырь сызнова на Юрточной горе, самой возвышенной во всей окрестности. В 1663 году постройку монастыря на новом месте завершил новый настоятель - схиигумен Исаия. Обитель располагалась рядом с церковью во имя Алексея Человека Божия, к тому времени более 30 лет стоявшей на Юрточной горе. После объединения обители с Алексеевской церковью Усть-Киргизский Богородицкий монастырь стал именоваться Богородице-Алексеевским. Новый монастырь представлял собой крепость и стал частью оборонительных сооружений Томска. За несколько лет обитель выдержала множество осад "со стороны калмацкого [калмыцкого] прихода", самая значительная из которых была в 1668 году.
Место первоначального устроения монастыря на реке Киргизке было отмечено старцем Исаией большим памятным крестом. Надпись на нем гласила: "Лета 7170 (1662) года устроен бысть си животворящий крест Господень, на нем же воображено распятие Господа нашего Иисуса Христа при державе благовернаго и благочестиваго Государя царя и Великаго князя Алексия Михайловича всея Великия и Малыя и Белыя России Самодержца по вере и обещанию Томского города монастыря Богородицы Казанския: строителя Исиии, яже о Христе с братиею. Писан в Кузнецком остроге".
В 1662 году в монастыре был возведен первый (всего за историю обители их было четыре) деревянный трехпрестольный храм в честь Казанской иконы Божией Матери с северным приделом во имя свв. мчч. Флора и Лавра и южным во имя Алексия человека Божия. В начале 1660-х годов строитель монастыря старец Исаия подал царю Алексею Михайловичу челобитную, в которой просил пожаловать обитель деньгами и ежегодной ругой. Царь повелел выдавать служителям монастыря жалование годового руга, а также прислал из царской ризницы богослужебные книги, иконы, колокола, облачения и всю необходимую церковную утварь.
К началу XVIII века обитель владела значительными земельными угодьями и рыбными промыслами. Увеличение монастырских угодий требовало множества рабочих рук. Монастырь набирал крестьян и рассылал их для заселения своих земельных наделов в Верхотомском стане, около Иштанской протоки и на р. Шегарке. Уже в 1760-х годах на монастырских наделах жило более 400 "мужских ревизских душ".
На момент своего создания в 1605 году монастырь, как и вся Сибирь, входил в состав Вологодской епархии. В 1620 году с назначением в Тобольск первого сибирского архиепископа Киприана (Старорусенкова) монастырь входит в состав Сибирской и Тобольской архиепископии вплоть до открытия в 1834 году самостоятельной Томской епархии. В 1681 году монастырь был принят под личное покровительство царя Феодора Алексеевича.
С момента своего основания монастырь становится крупным миссионерским центром. Уже в начале XVII века на острове Крестовом (Крещеном) при слиянии рек Томи и Оби монахами-миссионерами совершались первые крещения инородцев юга Сибири. А к середине XVII столетия на монастырских угодьях в Нагорном Иштане был устроен один из первых миссионерских станов.
В 1698 году настоятелем Ионой-греком в монастыре была основана русская школа, послужившая началом всей будущей образовательной системы Томска. В 1744-1746 годах по благословению епархиальной власти в обители открывается первое на юге Сибири русское духовное училище. В 1818 году трудами архимандрита Иеронима-"Гимназиарха" (Кириллова) была открыта первая в Томске русско-латинская гимназия. Через два года она была преобразована в Томское духовное училище. В XVII веке при монастыре появилась первая в крае больница. В исторических материалах XVIII века монастырская больница описывается уже как "довольно обширная" и имеющая хорошее устройство.
После реформы 1764 года были утрачены значительные земельные владения монастыря, он был причислен к разряду третьеклассных монастырей с казенным жалованием, в нем было упразднено архимандричье правление. Постепенно братия монастыря стала состоять из престарелых монахов.
С 1807 года Богородице-Алексиевский монастырь, как обитель губернского города, стал опять управляться архимандритом. По указу Св. Синода от 30 сентября 1809 года монастырь из штатного третьеклассного был обращен в общежительный. С 1835 года монастырь являлся резиденцией томских архиереев. На его территории был построен архиерейский дом.
В 1830-х годах вокруг монастыря впервые была возведена каменная ограда с главными и экономическими воротами и угловыми башнями, что придало монастырю величественный вид. В юго-восточной башне находилась антиминсная часовня, в которой совершались поминальные службы. Другая старинная часовня располагалась на монастырском кладбище. Настоящей достопримечательностью монастыря стал необычный сад, устроенный стараниями епископа Афанасия (Соколова) в южной части обители. Со своим озером, горой, монашескими кельями и кладбищем он представлял символический образ Святой Палестинской земли.
В 1882-1899 годах в монастыре размещалась духовная семинария. В 1898 году в монастырском флигеле была открыта школа грамоты, в которой, по сведениям 1900 года, обучалось 16 мальчиков.
Монастырь был закрыт летом 1923 года. Братия монастыря перешла на монастырскую заимку, т.н. "Архимандритскую". Здесь, на древнем месте расположения обители при устье р. Киргизки, находился загородный дом архимандритов и имелся деревянный Покровский храм. Вплоть до 1926 года здесь подвизалось 26 насельников монастыря, своим трудом добывая пропитание. В середине 1920-х годов началось полное уничтожение монастыря. В 1925-26 годах монахи, уже обреченные на смерть, проживали в братском корпусе. Им было запрещено выходить из келий под страхом смерти. Судьба всех насельников монастыря неизвестна, однако наибольшая часть братии была схвачена и расстреляна на горе Каштак.
Со временем территория монастыря была передана в ведение Педагогического училища № 2 и застроена новыми домами, несмотря на то, что в 1923 году монастырь был взят на учет музейным отделом Главнауки как памятник старины, имеющий государственное значение. Во время Великой Отечественной войны в монастыре размещались мастерские по пошиву военного обмундирования и школа санитарных инструкторов. В начале 1960-х годов были разобраны угловые башни и святые врата обители.
В 1980-х годах была предпринята попытка восстановить монастырский комплекс в качестве музея, ограничившаяся лишь частичной реставрацией храма обители.
В 1991 году территорию обители посетил Святейший Патриарх Алексий II. В 1992 году епископ Новосибирский и Бердский Тихон (Емельянов) совершил торжественное открытие монастыря. До 1994 года хозяином храма оставался художественный музей. В этом же году состоялось полное возвращение храма верующим. В 1995 году обители был передан отреставрированный Казанский собор. В этом же году состоялось обретение мощей св. прав. Феодора. В 1996 году был возвращен бывший настоятельский корпус, где теперь размещаются монашеские кельи.
Казанский храм. Каменный храм был заложен в 1776 году по благословению свт. Варлаама (Петрова), архиепископа Тобольского и всея Сибири. В 1779 году были освящены боковые приделы храма, посвященные святым мученикам Флору и Лавру (северный) и преподобному Алексию человеку Божию (южный). И лишь в 1789 году был освящен главный престол в честь Казанской иконы Божией Матери. Подлинным украшением монастыря стала колокольня храма, построенная в 1860 году. В 1863 году на нее был поднят «Торжественный» 303-пудовый колокол. Сначала во втором ярусе колокольни хотели разместить престол во имя св. прав. Лазаря Четверодневного, но впоследствии здесь были устроены архив и хранилище древностей монастыря. После закрытия монастыря храм продолжал действовать как приходской. 17 декабря 1929 года решением Сибирского крайисполкома в г. Томске церковь была закрыта. Со временем она была частично разобрана. В начале 1980-х годов храм представлял собой "... обрубок старинного здания с остатками купола". Ко времени начала воссоздания монастыря в конце XX века не сохранились колокольня, апсида, завершения и покрытия самого храма. В начале 1990-х годов были проведены масштабные реставрационные работы, в результате которых храм был полностью восстановлен.
Часовня св. Феодора Томского. В 1904 года над могилой всенародно почитаемого старца св. Феодора, расположенной по его завещанию в ограде монастыря, была построена каменная часовня. На главной часовенной иконе были изображены св. блгв. кн. Александр Невский - небесный покровитель Императора Александра I и св. Феодор Стратилат - покровитель старца Феодора Кузьмича. В советское время была разобрана на кирпичи для сооружения светских зданий. В 1997-1998 годах часовня-памятник была восстановлена по первоначальному проекту на прежних фундаментах.
Трехсвятительский храм.
Храм при вратах. Построен в конце XX - начале XXI века.
https://drevo-info.ru/articles/23888.html
Летопись монастыря
1605 г. - Основание Усть-Киргизского (Богородского) мужского монастыря в 9 верстах от Томска на р. Большая Киргизка.
1606 г. - половодьем сносятся церковь и монастырские постройки. Монастырь переносится на более высокое и безопасное место вверх по течению реки.
1620 г. - с назначением в Тобольск первого сибирского архиепископа Киприана монастырь входит в состав Сибирской и Тобольской архиепископии (до этого находился в составе Вологодской епархии).
1656 г. - случился пожар, уничтоживший новый деревянный храм обители. Монастырь переносится в Томск на Юрточную гору.
1656 г. - Царь Алексей Михайлович пожаловал монастырю первый надел земельных владений за пределами Томска.
1662 г. - в монастыре был возведен первый деревянный трехпрестольный храм в честь Казанской иконы Божией Матери с приделами в честь преподобного Алексия Человека Божия и мучеников Флора и Лавра.
1663 г. - завершение строительства монастыря на новом месте.
1681 г. - монастырь в числе трех старейших сибирских обителей принят под личное покровительство царя Феодора Алексеевича.
1695 г. - игумены Богородице-Алексиевского монастыря получают сан архимандритов.
1698 г. - в монастыре была открыта первая в Томске школа.
С 17 века при монастыре организована первая в городе больница и богадельня.
1746г. - в монастыре открывается русское духовное училище.
1750-е г.г. -архим. Исайя установил «начальствующий монастырский благовест»: городские церкви должны были начинать и заканчивать колокольные звоны по звону монастырской церкви.
1764 г. - монастырь становится штатным и причисляется к 3-му классу. Его настоятели вновь становятся игуменами.
1769 г. - к томской обители был присоединен Кузнецкий Христорождественский монастырь.
1776 г. - закладывается первый каменный храм обители.
1779 г. - освящаются боковые приделы нового храма в честь преподобного Алексия Человека Божия и мучеников Флора и Лавра.
1789 г. - освящается главный придел храма в честь Казанской иконы Божией Матери.
1807 г. - восстановление архимандритии в монастыре.
1818 г. - при монастыре устроена русско-латинская гимназия.
1820 г. - гимназия преобразована в Томское духовное училище.
1834 г. - открытие Томской епархии.
1835 г. - Богородице-Алексиевский монастырь становится резиденцией томских архиереев, на территории монастыря был построен архиерейский дом.
1836 г. - начата постройка каменной монастырской ограды.
1860 г. - строится колокольня каменного собора.
1863 г. - в обители установлен «Торжественный» 303-пудовый колокол.
1864 г. - кончина старца Феодора Кузьмича (св. прав. Феодора Томского).
1884 г. - в монастыре был построен каменный настоятельский корпус.
1891 г. - обитель посещает Цесаревич Николай Александрович, будущий царь Николай II.
1904 г. - над склепом св. Феодора Томского возводится каменная часовня.
1908 г. - настоятелями Богородице-Алексиевского монастыря становятся викарные епископы с титулом «Барнаульский».
1923 г. - закрытие монастыря; последним настоятелем обители был архимандрит Ираклий (Попов), который, впоследствии став епископом на Урале, расстрелян в 30-х годах.
1923 г. - многочисленные явления св. прав. Старца Феодора Томского у часовни и над стенами обители.
1936 г. - сгорело, было перестроено и отчуждено от монастыря здание архиерейского дома и домовой церкви.
1936 г. - была разобрана часовня св. прав. Феодора Томского.
1937 г. - была подожжена загородная церковь Покрова Пресвятой Богородицы.
1941-45 г.г. - в монастыре располагается военный госпиталь.
1960-е г.г. - разбирается каменная ограда и ворота обители.
1991 г. - территорию обители посетил Святейший Патриарх Алексий II.
1992 г. - епископ Новосибирский и Бердский Тихон совершил торжественное открытие Томского Богородице-Алексиевского монастыря.
1995 г. - обители был передан отреставрированный Казанский собор.
1995 г. - состоялось обретение мощей св. прав. Феодора.
1996 г. - возвращен бывший настоятельский корпус, где теперь размещаются монашеские кельи.
1996-1998 г.г. - восстановлена часовня св. прав. Феодора Томского.
1999г. - наместником монастыря был назначен ныне действующий игумен Силуан (Вьюров).
http://tbam.ru/O_monastire/Istoriya_i_sovremennost/
Богородице-Алексиевский мужской монастырь г. Томска был основан в 1605 году в 9 верстах от Томска на р. Большая Киргизка и получил название Усть-Киргизский (Богородский). В 1656 году случился пожар, уничтоживший деревянный храм обители. Монастырь перенесли в Томск на Юрточную гору.
В 1662 году в монастыре был возведен первый деревянный трехпрестольный храм в честь Казанской иконы Божией Матери с приделами в честь преподобного Алексия, человека Божия, и мучеников Флора и Лавра. В 1681 году монастырь в числе трех старейших сибирских обителей был принят под личное покровительство царя Феодора Алексеевича. В 1695 году игумены Богородице-Алексиевского монастыря получили сан архимандритов.
В 1698 году в монастыре была открыта первая в Томске школа. С XVII века при монастыре организована первая в городе больница и богадельня. В 1746 году в монастыре открыто русское духовное училище. В 1764 году монастырь стал штатным и причислен к 3-му классу. Его настоятели вновь стали игуменами.
Первый каменный, ныне существующий храм обители был заложен в 1776 году. В 1779 году были освящены боковые приделы, а в 1789 году — главный придел храма в честь Казанской иконы Божией Матери.
В 1818 году при монастыре устроена русско-латинская гимназия, преобразованная затем в Томское духовное училище. После открытия Томской епархии с 1834 г. по 1883 г. Богородице-Алексиевский монастырь стал резиденцией томских архиереев, на территории монастыря был построен архиерейский дом.
В 1864 году в ограде обители был похоронен святой праведный старец Феодор Томский. Могила старца сделалась местом паломничества. Казанский храм и могилу старца Феодора у алтаря храма посещали многие известные и выдающиеся люди России, в том числе представители царского Дома Романовых: великие князья Владимир Александрович (1868) и Алексей Александрович (1873), цесаревич (с 1894 г. — император) Николай Александрович (1891). В 1904 году над склепом св. Феодора Томского почитателями старца была возведена каменная часовня.
В 1923 году монастырь был закрыт; последним настоятелем обители был архимандрит Ираклий (Попов), который, впоследствии став епископом на Урале, был расстрелян в 30-х годах. В том же году происходили многочисленные явления святого праведного Феодора Томского у часовни и над стенами обители. По одним сведениям, насельники обители были расстреляны в Томске, на Каштачной горе, по другим — монашеская братия перешла на свою заимку в устье реки Большой Киргизки, где просуществовала до лета 1937 года. Дальнейшая судьба насельников осталась неизвестна.
В 1941-1945 гг. в монастыре располагался военный госпиталь. Со временем монастырские здания были переданы Томскому педагогическому техникуму, в том числе и частично разобранная Казанская церковь, с которой сорвали все главы с крестами, снесли колокольню, переоборудовали ее помещение под мастерские и хозяйственные нужды, а затем в ней устроили спортзал.
В 1992 году здание Казанского храма и часть келейного корпуса было полностью передано Томскому благочинию Русской Православной Церкви. В пасхальную ночь 1992 года состоялось первое богослужение в реставрируемом храме.
5 июля 1995 года состоялось обретение мощей святого праведного Феодора Томского. Мощи пребывают в Казанском храме монастыря. В 1996-1998 гг. была восстановлена часовня над местом его захоронения.
Начиная с 1992 года монастырь восстанавливался практически из руин. За это время был полностью восстановлен Казанский храм, в том числе и на средства, выделенные государством в рамках программы «Культура России». Была заново отстроена монастырская стена, расселены жилые дома, находившиеся на монастырской территории. В 2006-2010 гг. в ограде обители был возведен новый трехэтажный корпус с домовым храмом во имя Трех святителей. В нем открылся церковно-культурный центр и детская воскресная школа. В монастыре действует самая большая в городе библиотека духовной литературы. В настоящее время начались строительные работы по возведению северного корпуса монастыря.
